Последовательность пептида

Как рассчитывается pI?

Изоэлектрическая точка (pI) — это pH, при котором молекула имеет нулевой суммарный заряд. Расчёт основан на pKa ионизируемых групп: α-аминогруппа (N-конец, pKa ~9.7), α-карбоксильная группа (C-конец, pKa ~2.3) и боковые цепи кислотных (Asp, Glu — pKa ~4.0) и основных аминокислот (Lys — pKa ~10.5, Arg — pKa ~12.5, His — pKa ~6.0). Алгоритм: определяем заряд при различных pH и находим pH, при котором суммарный заряд равен нулю.

Результат расчёта

📖 Примеры пептидов

FLAG-пептид

DYKDDDDK (pI ≈ 4.0-4.5)

Лей-энкефалин

Тирозин-глицин-глицин-фенилаланин-лейцин

Короткий пептид

Глутамин-глутамин-лейцин-аланин

Полилизин

Основной пептид, pI ~10.5

Полиаспартат

Кислотный пептид, pI ~3.0-3.5

Смешанный

Аргинин-гистидин-триптофан-тирозин