Последовательность белка

Как рассчитывается ε280?

Метод Gill & von Hippel (1989):
ε280 (M⁻¹·см⁻¹) = (nW × 5500) + (nY × 1490) + (nC × 125)
где nW — число триптофанов (Trp, W), nY — число тирозинов (Tyr, Y), nC — число цистеинов (Cys, C).

Удельный коэффициент A₁% (1 г/100 мл, 1 см):
A₁% = ε280 / (M/10), где M — молекулярная масса белка в Да.

Примечание: Расчёт учитывает только восстановленные цистеины (без дисульфидных мостиков). При наличии дисульфидных связей реальное поглощение может быть ниже.

Результат расчёта

📖 Примеры белков

EGF (человеческий)

Эпидермальный фактор роста

Гемоглобин α-цепь

HBA1, содержит гем (доп. поглощение)

His-метка

6×His, нет Trp/Tyr/Cys

Тестовый

Trp, Tyr, Cys для проверки

Альбумин (человеческий)

Длинная последовательность

※ Гемоглобин содержит гем-группу, которая дополнительно поглощает при 280 нм — результат может отличаться от экспериментального.