Параметры молекулярной эволюции
Количество несинонимичных замен на несинонимичный сайт
Количество синонимичных замен на синонимичный сайт

Что такое dN/dS (ω)?

dN — количество несинонимичных замен (изменяющих аминокислоту) на один несинонимичный сайт.
dS — количество синонимичных замен (не изменяющих аминокислоту) на один синонимичный сайт.
ω = dN/dS — показатель давления отбора:

📊 Шкала интерпретации ω:
ω = 0: █░░░░░░░░░ Максимальный очищающий отбор (dN = 0)
0 < ω < 0.1: ██░░░░░░░░ Сильный очищающий отбор
0.1 ≤ ω < 0.5: ████░░░░░░ Умеренный очищающий отбор
0.5 ≤ ω < 0.95: ██████░░░░ Слабый очищающий отбор
0.95 ≤ ω ≤ 1.05: ████████░░ Нейтральная эволюция
1.05 < ω < 2.0: █████████░ Слабый положительный отбор
ω ≥ 2.0: ██████████ Сильный положительный отбор
ω → ∞: ⚠️ Бесконечность (dS = 0, dN > 0)

Результат расчёта

📖 Примеры эволюционного давления

Очищающий отбор

dN=0.012, dS=0.048 → ω=0.25

Нейтральная эволюция

ω=1.0

Положительный отбор

ω=3.0 > 1

Максимальный консерватизм

ω=0 (dN=0)

Найти dN

ω=0.5, dS=0.04 → dN=0.02

Найти dS

ω=2, dN=0.08 → dS=0.04